Hydroxychloroquin wird sowohl zur Behandlung und Vorbeugung von Malaria als auch für die Behandlung von rheumatoider Arthritis oder diskoider und systemischer Lupus Erythematodes eingesetzt. Cytochrom P450-Enzyme metabolisieren Hydroxychloroquin zu N-Desethylhydroxychloroquin. Diese Verbindungen hemmen die CYP2D6-Aktivität und können somit mit anderen Medikamenten interagieren, die von diesem Enzym abhängen.