Zusätzlich übernimmt Christoph Arnoldner, der Leiter des Christian Doppler Labors für Innenohrforschung, auch die Leitung der Universitätsklinik für Hals-, Nasen- und Ohrenheilkunde der MedUni Wien. Unter seiner Führung soll die internationale Vorreiterrolle der Klinik im Bereich der Hörimplantate und Otologie gefestigt und andere Bereiche wie jene der Onkologie im Kopf-Halsbereich und der Rhinologie gestärkt werden. 

Der bisherige stellvertretende Leiter der Klinik etablierte das Minipig als neues Großtiermodell für die otologische Forschung, welches bis heute von zahlreichen Forschungseinrichtungen übernommen wurde. Außerdem war er an der Erforschung neuer Wirkstoffe für die Behandlung von Hörstörungen beteiligt, die mittlerweile bereits den Weg in klinische Studien gefunden haben. Dieser Forschungsbereich soll in den nächsten Jahren weiter gestärkt werden und speziell bei den aktuell beginnenden klinischen Gentherapie-Studien zur Behandlung von Hörstörungen soll die Wiener Klinik aktiv beteiligt sein. 

Christoph Arnoldner studierte Medizin in Wien und Paris. Die Ausbildung zum Facharzt für Hals-Nasen-Ohrenheilkunde erfolgte an der Medizinischen Hochschule Hannover, der JW Goethe Universitätsklinik Frankfurt a. Main und in Wien. Im Alter von 30 Jahren erfolgte die Habilitation zu psychoakustischen Studien mit Cochlea-Implantaten. 2012 absolvierte Christoph Arnoldner ein klinisches Fellowship an der University of Toronto für Otologie und Schädelbasischirurgie. Zurück in Wien wurden diese Gebiete ausgebaut und Wien als Referenzzentrum etabliert, ebenso erfolgte die Verankerung der Fellowship-Programme für weitere Klinikmitarbeiter:innen. 2022 kam es zur Gründung des Christian Doppler Labors für Innenohrforschung. Christoph Arnoldner ist Vorstandsmitglied der Arbeitsgruppe deutschsprachiger Audiologen, Otologen und Neurootologen und Mitglied in zahlreichen nationalen und internationalen Gremien.